Der Erlenzeisig brütet vor allem in den Fichtenwälder der Alpen und des Juras. Er lässt sich bevorzugt dort nieder, wo das aktuelle Samenangebot gute Aufzuchtsmöglichkeiten für die Jungen verspricht. Im Winter kommt er in die Niederungen und mischt sich unter die Wintergäste die aus Norden einfliegen. Im Winter sieht man ihn oft an den Erlenzäpfchen nach Samen suchend.